MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 24630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018621	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018621	C	7	7	67	73	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_018621	AGA	3	9	77	85	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018621	TA	3	6	95	100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018621	CGA	2	6	172	177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456173
6	NC_018621	AGA	2	6	190	195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456173
7	NC_018621	CTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456173
8	NC_018621	T	7	7	258	264	0 %	100 %	0 %	0 %	407456173
9	NC_018621	AAGG	2	8	268	275	50 %	0 %	50 %	0 %	407456173
10	NC_018621	A	6	6	276	281	100 %	0 %	0 %	0 %	407456173
11	NC_018621	GT	3	6	311	316	0 %	50 %	50 %	0 %	407456173
12	NC_018621	TCT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456173
13	NC_018621	A	7	7	480	486	100 %	0 %	0 %	0 %	407456173
14	NC_018621	TG	3	6	500	505	0 %	50 %	50 %	0 %	407456173
15	NC_018621	TAT	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456173
16	NC_018621	ATG	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456173
17	NC_018621	GCGT	2	8	590	597	0 %	25 %	50 %	25 %	407456173
18	NC_018621	TGT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456173
19	NC_018621	ATG	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456173
20	NC_018621	TC	3	6	729	734	0 %	50 %	0 %	50 %	407456173
21	NC_018621	ACA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456173
22	NC_018621	AGC	2	6	966	971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456173
23	NC_018621	GTG	2	6	983	988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456173
24	NC_018621	AGC	3	9	1002	1010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456173
25	NC_018621	CTA	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456173
26	NC_018621	GGT	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456173
27	NC_018621	CTT	2	6	1130	1135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456173
28	NC_018621	TTC	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018621	GAA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018621	CTT	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456174
31	NC_018621	AC	3	6	1297	1302	50 %	0 %	0 %	50 %	407456174
32	NC_018621	TTAA	2	8	1355	1362	50 %	50 %	0 %	0 %	407456174
33	NC_018621	ACA	2	6	1367	1372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456174
34	NC_018621	ATG	2	6	1415	1420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456174
35	NC_018621	GT	3	6	1463	1468	0 %	50 %	50 %	0 %	407456174
36	NC_018621	TTA	2	6	1514	1519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456174
37	NC_018621	TAG	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456174
38	NC_018621	TC	3	6	1586	1591	0 %	50 %	0 %	50 %	407456174
39	NC_018621	TAG	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456174
40	NC_018621	CTA	2	6	1770	1775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456174
41	NC_018621	TTC	2	6	1791	1796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456174
42	NC_018621	TG	3	6	1890	1895	0 %	50 %	50 %	0 %	407456174
43	NC_018621	ATA	2	6	1991	1996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456174
44	NC_018621	CTT	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456174
45	NC_018621	GAA	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456174
46	NC_018621	TGA	2	6	2130	2135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456174
47	NC_018621	GAT	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456174
48	NC_018621	GTT	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456174
49	NC_018621	CTT	2	6	2208	2213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456174
50	NC_018621	T	6	6	2212	2217	0 %	100 %	0 %	0 %	407456174
51	NC_018621	T	8	8	2291	2298	0 %	100 %	0 %	0 %	407456174
52	NC_018621	TAA	2	6	2370	2375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456174
53	NC_018621	GAA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456174
54	NC_018621	AGAT	2	8	2545	2552	50 %	25 %	25 %	0 %	407456174
55	NC_018621	T	8	8	2619	2626	0 %	100 %	0 %	0 %	407456175
56	NC_018621	T	8	8	2631	2638	0 %	100 %	0 %	0 %	407456175
57	NC_018621	AGT	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456175
58	NC_018621	TTA	2	6	2658	2663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456175
59	NC_018621	TCC	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456175
60	NC_018621	T	6	6	2732	2737	0 %	100 %	0 %	0 %	407456175
61	NC_018621	TTC	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456175
62	NC_018621	GA	3	6	2788	2793	50 %	0 %	50 %	0 %	407456175
63	NC_018621	TTA	2	6	2805	2810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456175
64	NC_018621	TGTT	2	8	2843	2850	0 %	75 %	25 %	0 %	407456175
65	NC_018621	T	6	6	2887	2892	0 %	100 %	0 %	0 %	407456175
66	NC_018621	T	6	6	2899	2904	0 %	100 %	0 %	0 %	407456175
67	NC_018621	AGA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456175
68	NC_018621	GAAG	2	8	2954	2961	50 %	0 %	50 %	0 %	407456175
69	NC_018621	TAT	2	6	2974	2979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456175
70	NC_018621	AGTA	2	8	2984	2991	50 %	25 %	25 %	0 %	407456175
71	NC_018621	TAT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456175
72	NC_018621	T	6	6	3013	3018	0 %	100 %	0 %	0 %	407456175
73	NC_018621	TAT	2	6	3060	3065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018621	ATT	3	9	3075	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018621	TGT	2	6	3088	3093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018621	T	6	6	3104	3109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018621	GAA	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
78	NC_018621	TTTG	2	8	3302	3309	0 %	75 %	25 %	0 %	407456176
79	NC_018621	TCCT	2	8	3328	3335	0 %	50 %	0 %	50 %	407456176
80	NC_018621	GA	3	6	3342	3347	50 %	0 %	50 %	0 %	407456176
81	NC_018621	GAAAA	2	10	3358	3367	80 %	0 %	20 %	0 %	407456176
82	NC_018621	ATG	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456176
83	NC_018621	AGT	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456176
84	NC_018621	CTT	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456176
85	NC_018621	CAA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456176
86	NC_018621	ATG	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456176
87	NC_018621	ATC	2	6	3781	3786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456176
88	NC_018621	TGG	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456176
89	NC_018621	AGA	2	6	4145	4150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
90	NC_018621	T	6	6	4193	4198	0 %	100 %	0 %	0 %	407456176
91	NC_018621	TAA	2	6	4211	4216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456176
92	NC_018621	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	407456176
93	NC_018621	GAA	2	6	4248	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
94	NC_018621	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456176
95	NC_018621	TAA	2	6	4315	4320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456176
96	NC_018621	AGA	2	6	4435	4440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
97	NC_018621	CTT	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456176
98	NC_018621	ATG	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456176
99	NC_018621	GAT	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456176
100	NC_018621	GCT	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456176
101	NC_018621	CT	3	6	4731	4736	0 %	50 %	0 %	50 %	407456176
102	NC_018621	GAA	2	6	4811	4816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
103	NC_018621	CTGTGG	2	12	4822	4833	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407456176
104	NC_018621	AAG	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
105	NC_018621	TGG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456176
106	NC_018621	AAG	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
107	NC_018621	AGA	2	6	5114	5119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
108	NC_018621	TTA	2	6	5134	5139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456176
109	NC_018621	CAA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456176
110	NC_018621	GAAA	2	8	5257	5264	75 %	0 %	25 %	0 %	407456176
111	NC_018621	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018621	TTG	2	6	5351	5356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018621	AATC	2	8	5416	5423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018621	T	7	7	5459	5465	0 %	100 %	0 %	0 %	407456177
115	NC_018621	AGA	2	6	5522	5527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456177
116	NC_018621	CGAG	2	8	5528	5535	25 %	0 %	50 %	25 %	407456177
117	NC_018621	TGG	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456177
118	NC_018621	TAT	2	6	5623	5628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456177
119	NC_018621	GTT	2	6	5669	5674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456177
120	NC_018621	CAA	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456177
121	NC_018621	GAT	2	6	5712	5717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456177
122	NC_018621	TGT	2	6	5732	5737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456177
123	NC_018621	GGA	2	6	5754	5759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456177
124	NC_018621	T	6	6	5788	5793	0 %	100 %	0 %	0 %	407456177
125	NC_018621	CAA	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456177
126	NC_018621	TGA	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456177
127	NC_018621	GAT	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456177
128	NC_018621	TGT	3	9	5985	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456177
129	NC_018621	TGA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456177
130	NC_018621	GCT	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456177
131	NC_018621	T	7	7	6074	6080	0 %	100 %	0 %	0 %	407456177
132	NC_018621	TGC	2	6	6224	6229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456177
133	NC_018621	TGA	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456177
134	NC_018621	GAA	2	6	6276	6281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456177
135	NC_018621	A	6	6	6280	6285	100 %	0 %	0 %	0 %	407456177
136	NC_018621	GAG	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456177
137	NC_018621	TTC	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456177
138	NC_018621	CCT	2	6	6306	6311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456177
139	NC_018621	CTT	2	6	6352	6357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456177
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269	NC_018621	GA	3	6	12447	12452	50 %	0 %	50 %	0 %	407456182
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